Dopo che il telefono cellulare è stato flashato o rootato, il telefono cellulare potrebbe non raggiungere il miglior stato di funzionamento e alcune funzioni software e hardware del telefono cellulare potrebbero non funzionare correttamente. Inoltre, il firmware di terze parti non è completamente testato, quindi potrebbero esserci problemi di compatibilità. Inoltre, la sicurezza del sistema non può essere garantita, e il sistema può essere facilmente attaccato da virus e alcuni programmi maligni possono essere impiantati, con conseguente perdita di informazioni personali o di proprietà.

Il flashing del sistema o il root possono anche portare effetti negativi inaspettati. Pertanto, fate attenzione quando eseguite questa operazione.

In caso di guasto del software/hardware del portatile causato dal flashing o dal root, i punti di riparazione post-vendita non gestiranno il guasto in garanzia, ma lo faranno pagare come una normale riparazione del software fuori garanzia. Dovete sopportare i rischi del flashing del telefono cellulare senza permesso, per esempio, il telefono cellulare non può essere usato correttamente. Se il software non può essere ripristinato, è necessario sostenere i costi.